11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2153 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2153  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3027  hypothetical protein  41.78 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2630  putative peptidase A2A  42.91 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.550305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  38.13 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  32.76 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2238  hypothetical protein  26.15 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.982466  normal  0.0285767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  24.22 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4924  hypothetical protein  22.95 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.157261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  21.82 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2880  hypothetical protein  25.95 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1732  aspartyl protease-like protein  31.11 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>