13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3027 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3027  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2153  hypothetical protein  40.59 
 
 
325 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2630  putative peptidase A2A  43.12 
 
 
311 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.550305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  35.82 
 
 
342 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  29.43 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2238  hypothetical protein  27.54 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.982466  normal  0.0285767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4924  hypothetical protein  30.56 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.157261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  31.54 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  25.37 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  36.08 
 
 
188 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00460  SNARE binding protein, putative  26.72 
 
 
434 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.89668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  32.88 
 
 
361 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  31.03 
 
 
220 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>