12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0703 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.48 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5356  hypothetical protein  27.56 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0885062  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  22.97 
 
 		 435 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  24.03 
 
 		 625 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24 
 
 		 422 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3027  hypothetical protein  31.54 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  30.16 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  27.19 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0871  hypothetical protein  27.1 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0369411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2072  hypothetical protein  22.82 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0107899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0526  hypothetical protein  28.39 
 
 		 505 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>