53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3870 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 422 aa  861    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  59.29 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.88 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  31.55 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.77 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  22.25 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.88 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  27.76 
 
 		 625 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  23.02 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.25 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.71 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  38.95 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1877  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 515 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  24 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1827  hypothetical protein  25.65 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  21.4 
 
 		 298 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0871  hypothetical protein  23.24 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0369411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  31.3 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  26.06 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  25.35 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  31.71 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  30.53 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  31.03 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  42.59 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  27.83 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  31.03 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  32.56 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3915  hypothetical protein  24.65 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.58 
 
 		 668 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  29.33 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  23.97 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  27.68 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  29.9 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.91 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.75 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  29.47 
 
 		 477 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  30.21 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  23.65 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.62 
 
 		 443 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  30.93 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  28.33 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  30.93 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.36 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>