20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3592 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  84.99 
 
 		 413 aa  736    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 412 aa  845    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  25.21 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.8 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.19 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1274  hypothetical protein  23.24 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00244151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2925  hypothetical protein  22.9 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.49 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15451  hypothetical protein  28.71 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  26.15 
 
 		 641 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  32.98 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  25.56 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  20.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  22.08 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  31.78 
 
 		 594 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.75 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  26.57 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0473  hypothetical protein  28.97 
 
 		 323 aa  43.1  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>