16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2079 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1291    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  28.43 
 
 		 625 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.93 
 
 		 421 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.02 
 
 		 422 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.04 
 
 		 417 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  20.71 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.27 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2072  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0107899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  23.23 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  30.56 
 
 		 282 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 555 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.15 
 
 		 412 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.74 
 
 		 413 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  22.03 
 
 		 239 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.57 
 
 		 668 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  19.17 
 
 		 444 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>