17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4697 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2294  hypothetical protein  56.19 
 
 		 278 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2295  putative signal peptide protein  39.82 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4698  hypothetical protein  38.98 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3020  putative signal peptide protein  29.55 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0732227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1283  conserved hypothetical signal peptide protein  25.2 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0539757  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4628  conserved hypothetical signal peptide protein  25 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2379  hypothetical protein  27.18 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  22.08 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0867  hypothetical protein  24.27 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00009097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1183  hypothetical protein  22.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  30.56 
 
 		 641 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  24.54 
 
 		 687 aa  49.3  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3469  hypothetical protein  26.37 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3489  hypothetical protein  30.11 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3553  hypothetical protein  30.11 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3406  hypothetical protein  28.8 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>