11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4698 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4698  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2295  putative signal peptide protein  63.64 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2294  hypothetical protein  42.61 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  39.37 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3020  putative signal peptide protein  35.06 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0732227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1283  conserved hypothetical signal peptide protein  32.54 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0539757  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4628  conserved hypothetical signal peptide protein  29.08 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2379  hypothetical protein  28.25 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  25.4 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0867  hypothetical protein  23.5 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00009097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  26.8 
 
 		 625 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>