36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3810 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  100 
 
 		 625 aa  1246    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  28.43 
 
 		 641 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.76 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.58 
 
 		 421 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.14 
 
 		 393 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  25.57 
 
 		 435 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  25.55 
 
 		 457 aa  90.9  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.77 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.21 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.21 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  21.52 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.6 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2072  hypothetical protein  26.4 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0107899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  24.03 
 
 		 309 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  23.59 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  23.08 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 425 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  29.85 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  38.57 
 
 		 1103 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1877  hypothetical protein  26.72 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  29.29 
 
 		 166 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  30 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2925  hypothetical protein  21.34 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  23.08 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  29.73 
 
 		 457 aa  45.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  34.29 
 
 		 395 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  32.84 
 
 		 474 aa  44.3  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0867  hypothetical protein  30.84 
 
 		 242 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00009097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  32.84 
 
 		 474 aa  43.9  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>