19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1685 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.28 
 
 		 417 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.25 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.92 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  25.57 
 
 		 625 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.08 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  22.71 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2072  hypothetical protein  25.36 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0107899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  24.76 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.74 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3915  hypothetical protein  22.65 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  22.97 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  23.23 
 
 		 641 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2253  hypothetical protein  20.59 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.101541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5884  hypothetical protein  28.33 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139697  normal  0.0155606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  25.51 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.08 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2238  hypothetical protein  28.42 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.982466  normal  0.0285767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3567  hypothetical protein  20.75 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0186066  normal  0.0993584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>