28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5609 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 421 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  59.29 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.25 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.09 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  31.74 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.17 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  24.92 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  26.58 
 
 		 625 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  25.93 
 
 		 641 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  28.78 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  28.78 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1877  hypothetical protein  26.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.49 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  21.39 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 515 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.88 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  32.31 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  29.91 
 
 		 560 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1270  hypothetical protein  33.66 
 
 		 145 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  31.58 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.86 
 
 		 668 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  33.85 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  33.68 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0119  hypothetical protein  22.11 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33.71 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  30.43 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>