12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1829 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  858    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  98.12 
 
 		 426 aa  843    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  25.56 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.78 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  30.83 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  23.59 
 
 		 625 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  22.69 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.35 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0600  hypothetical protein  22.53 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.53 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1877  hypothetical protein  23.4 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1692  hypothetical protein  22.89 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.272478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>