19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4030 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  790    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2253  hypothetical protein  27.47 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.101541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.78 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  27.17 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  24.6 
 
 		 625 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.19 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.2 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.25 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  20.21 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  20.57 
 
 		 457 aa  53.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2691  hypothetical protein  28.26 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.39 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.45 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1823  hypothetical protein  28.28 
 
 		 124 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4041  hypothetical protein  29.29 
 
 		 124 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5884  hypothetical protein  22.54 
 
 		 280 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139697  normal  0.0155606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1274  hypothetical protein  24.1 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00244151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  22.53 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>