17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3643 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 413 aa  847    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  84.99 
 
 		 412 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  25.21 
 
 		 625 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.93 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.2 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2925  hypothetical protein  22.81 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.88 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  25.74 
 
 		 641 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15451  hypothetical protein  26.73 
 
 		 196 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2691  hypothetical protein  22.64 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  30.11 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  30.95 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  30.69 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  29.76 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  30.69 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  28.71 
 
 		 386 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>