36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0001 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 417 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.25 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.88 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  30.18 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.29 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  24.28 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.79 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.78 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  22.77 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.8 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.93 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  24.19 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  23.04 
 
 		 641 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  36.11 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3915  hypothetical protein  23.78 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  34.02 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2072  hypothetical protein  22.63 
 
 		 297 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0107899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  26.04 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2691  hypothetical protein  25.71 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  30.34 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  33.33 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  33.33 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  32.39 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  32.86 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  32.88 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  32.88 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  19.18 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.21 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  37.7 
 
 		 446 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>