More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0288 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  92.7 
 
 		 365 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  100 
 
 		 370 aa  734    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  63.14 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  62.06 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  61.14 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  61.14 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  61.14 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  59.62 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  59.62 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  59.62 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  59.62 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  59.62 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  59.62 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  59.62 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  59.62 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  59.62 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  58.81 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4353  serine endoprotease  59.08 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.139323  hitchhiker  0.00320689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  58.27 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  58.27 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  58.27 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  58.27 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  58.27 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  47.15 
 
 		 355 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  47.28 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  46.99 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  49.43 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  46 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  48.7 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  47.41 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1049  DegS serine peptidase  46.93 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0146114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  43.9 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  43.9 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  43.9 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  43.9 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  43.58 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  44.44 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  44.73 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  44.73 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  43.14 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  43.9 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  44.73 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  44.72 
 
 		 359 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  45.14 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  44.03 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.16 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03179  serine protease DegS  39.63 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00219813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  46.48 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0554  PDZ/DHR/GLGF  42.4 
 
 		 328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00992555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4347  serine protease DegS  42.9 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.43 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  45.87 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  45.26 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  45.26 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.35 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  40.23 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  43.43 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  42.98 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.96 
 
 		 401 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  40.96 
 
 		 401 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.96 
 
 		 401 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  40.66 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.66 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  40.66 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.66 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  45.7 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.42 
 
 		 404 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  38.56 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  45.7 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  40.72 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  40.58 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  40.58 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  46.89 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  40.42 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  39.13 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  37.28 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  40.42 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  39.88 
 
 		 385 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.55 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  40.12 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  40 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  40.12 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  40.17 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  40.12 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.32 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.92 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  40.12 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  40.94 
 
 		 388 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.79 
 
 		 398 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  38.15 
 
 		 384 aa  205  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  39.36 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  45.99 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.35 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  38.66 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  39.16 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  39.04 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.66 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.18 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>