More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2880 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  100 
 
 		 368 aa  734    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  50.7 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  50.56 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  50.56 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  49.29 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  55.05 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  50.56 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  50.56 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  50.56 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  50.84 
 
 		 360 aa  328  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  49.72 
 
 		 360 aa  325  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  50.56 
 
 		 360 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  50.28 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  50.28 
 
 		 360 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  48.91 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  49.72 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  48.77 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  50.85 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  52.44 
 
 		 354 aa  315  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  48.88 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  49.86 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  50 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  49.28 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  49.28 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  49.72 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  49.28 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  49.72 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  49.28 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  49.28 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  49.72 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  48.84 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  48.84 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  48.84 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  48.84 
 
 		 355 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  48.84 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  48.84 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  48.84 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  48.84 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  48.84 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  47.73 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  48.87 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4353  serine endoprotease  45.68 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.139323  hitchhiker  0.00320689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  45.75 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4347  serine protease DegS  48.87 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  48.7 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.75 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.55 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  44.55 
 
 		 401 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.55 
 
 		 401 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  43.98 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1049  DegS serine peptidase  45.81 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0146114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  44.24 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.24 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.24 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  43.15 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  43.15 
 
 		 388 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  44.11 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  42.98 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  43.15 
 
 		 402 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  43.15 
 
 		 402 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  43.15 
 
 		 402 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  43.15 
 
 		 402 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  44.24 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  43.9 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  44.01 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  42.86 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.36 
 
 		 398 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  44.01 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  42.77 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.22 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03179  serine protease DegS  39.07 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00219813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  39.85 
 
 		 386 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.9 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  40.64 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0554  PDZ/DHR/GLGF  44.16 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00992555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  39.59 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  42.6 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  40.26 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.06 
 
 		 465 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  41.92 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.02 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  43.03 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  42.46 
 
 		 385 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  42.2 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.25 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  40.68 
 
 		 372 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  41.18 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  40.84 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  42.49 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.18 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  41.43 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.3 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  41.43 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  44.84 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  43.75 
 
 		 386 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.83 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  39.41 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>