More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0741 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  96.39 
 
 
360 aa  690    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  100 
 
 
360 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  95.28 
 
 
360 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  96.39 
 
 
360 aa  690    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  96.11 
 
 
360 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  96.39 
 
 
360 aa  690    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  94.17 
 
 
360 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  92.78 
 
 
360 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  94.44 
 
 
360 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  79.49 
 
 
361 aa  568  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  81.11 
 
 
360 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  80.11 
 
 
361 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  80.11 
 
 
359 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  79.49 
 
 
359 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  76.82 
 
 
356 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  76.9 
 
 
358 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  52.71 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  51.14 
 
 
355 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  50.84 
 
 
368 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  49.86 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  49.16 
 
 
354 aa  315  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  49.15 
 
 
354 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  47.34 
 
 
354 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4353  serine endoprotease  47.7 
 
 
352 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.139323  hitchhiker  0.00320689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  47.14 
 
 
362 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  47.14 
 
 
362 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  47.14 
 
 
383 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  48.73 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  48.15 
 
 
355 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  48.15 
 
 
355 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  48.15 
 
 
355 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  48.15 
 
 
355 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  48.15 
 
 
355 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  48.15 
 
 
355 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  48.15 
 
 
355 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  48.15 
 
 
355 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  48.15 
 
 
355 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  48.31 
 
 
356 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.99 
 
 
412 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  48.02 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  48.02 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  48.02 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  48.02 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  44.51 
 
 
365 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  45.01 
 
 
370 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.5 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  47.92 
 
 
389 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  43.97 
 
 
386 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  44.03 
 
 
386 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4347  serine protease DegS  46.65 
 
 
356 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  43.92 
 
 
402 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  46.96 
 
 
380 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  47.92 
 
 
389 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03179  serine protease DegS  42.54 
 
 
356 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00219813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.2 
 
 
408 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1049  DegS serine peptidase  47.74 
 
 
348 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0146114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  42.97 
 
 
386 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.95 
 
 
398 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.87 
 
 
417 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  47.04 
 
 
385 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  39.79 
 
 
403 aa  255  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  53.41 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.43 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  53.03 
 
 
386 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  39.69 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  49.3 
 
 
383 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  43.43 
 
 
388 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  43.43 
 
 
402 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  39.59 
 
 
402 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  43.43 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  43.43 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0554  PDZ/DHR/GLGF  46.01 
 
 
328 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00992555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  43.43 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  43.43 
 
 
402 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  42.02 
 
 
407 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.08 
 
 
401 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  43.08 
 
 
401 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.08 
 
 
401 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  40.37 
 
 
392 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  42.51 
 
 
407 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.08 
 
 
401 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  43.08 
 
 
401 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.08 
 
 
401 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.62 
 
 
396 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  43.12 
 
 
388 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  42.81 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  43.16 
 
 
403 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  44.89 
 
 
372 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.6 
 
 
380 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.03 
 
 
383 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  38.18 
 
 
396 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  46.18 
 
 
513 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.71 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  46.76 
 
 
386 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  44.01 
 
 
385 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.95 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.16 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  42.72 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  41.35 
 
 
471 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>