21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2449 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.17 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  24.76 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.19 
 
 
417 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.14 
 
 
421 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2253  hypothetical protein  24.34 
 
 
371 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.101541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5884  hypothetical protein  25.81 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139697  normal  0.0155606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  24.64 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54765  predicted protein  29.63 
 
 
409 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2630  putative peptidase A2A  24.89 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.550305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2691  hypothetical protein  21.51 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  32.18 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.4 
 
 
422 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  31.06 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  36 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2153  hypothetical protein  23.61 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4924  hypothetical protein  31.91 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.157261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3027  hypothetical protein  25.37 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.56 
 
 
412 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
515 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  23.08 
 
 
625 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>