14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4409 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  732    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2309  hypothetical protein  36.95 
 
 
210 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0502  hypothetical protein  49.61 
 
 
189 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  42.14 
 
 
185 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  33.02 
 
 
220 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  44.09 
 
 
185 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0086  hypothetical protein  35.44 
 
 
175 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  42.28 
 
 
181 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0558  hypothetical protein  41.89 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.953712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  31.06 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0213  hypothetical protein  36.51 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.113759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0526  hypothetical protein  31.17 
 
 
505 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0124  hypothetical protein  30.43 
 
 
510 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  32.18 
 
 
160 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>