41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0391 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  48.37 
 
 
185 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  48.37 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0502  hypothetical protein  43.51 
 
 
189 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0086  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  92  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2309  hypothetical protein  39.16 
 
 
210 aa  92  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  42.28 
 
 
362 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  38.98 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  35.64 
 
 
425 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  37.97 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  36.05 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  34.48 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  34.88 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  34.88 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  33.33 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  34.88 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  28.87 
 
 
188 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  31.96 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  31.96 
 
 
163 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  35.06 
 
 
172 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  35.06 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  35.06 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  31.4 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  33.77 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  30.38 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  36.36 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  35.06 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  33.77 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  32.32 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  33.77 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  32.47 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
515 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  31.65 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  32.91 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  30.95 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  30.23 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  32.63 
 
 
249 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  31.65 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  29.87 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  30.23 
 
 
161 aa  41.2  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  28.43 
 
 
409 aa  40.8  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>