34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1155 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  496  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  44.61 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  40.24 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  29.58 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  32.5 
 
 		 174 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  29.51 
 
 		 425 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  38.55 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  31.01 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  27.91 
 
 		 409 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  35.37 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  28.57 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0027  hypothetical protein  28.79 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  32.56 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  32.93 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  28.46 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  35.77 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4032  hypothetical protein  28.1 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000100028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  34.07 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  31.4 
 
 		 170 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0227  hypothetical protein  34.04 
 
 		 370 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.186185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  26.77 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  32.56 
 
 		 169 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  32.63 
 
 		 181 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  40.48 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  40.48 
 
 		 220 aa  42  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  26.77 
 
 		 191 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  32.56 
 
 		 175 aa  42  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  34.09 
 
 		 163 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  34.09 
 
 		 163 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>