41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0227 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0227  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.186185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  38.14 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  25.84 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  36.7 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  32.41 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  34.26 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  33.94 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  38.3 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  28.79 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  32.74 
 
 		 174 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  32.71 
 
 		 158 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  26.85 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0585  hypothetical protein  27.56 
 
 		 212 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.013644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  33.63 
 
 		 172 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  28.87 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  28.87 
 
 		 214 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2503  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  28.81 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  31.19 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 543 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  31.75 
 
 		 191 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  36.11 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  33.68 
 
 		 172 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.4 
 
 		 746 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 515 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  31.07 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  24.82 
 
 		 539 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  23.08 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  23.91 
 
 		 202 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.66 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24 
 
 		 706 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00910  chaperone, putative  34.33 
 
 		 584 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>