49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0702 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 393 aa  800    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.17 
 
 		 421 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.88 
 
 		 422 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  25.14 
 
 		 625 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.79 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.62 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  25.51 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3915  hypothetical protein  27.95 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  47.46 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  45.76 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  45.76 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  45.76 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  45.76 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  21.68 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  45.9 
 
 		 451 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  44.07 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  44.07 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  44.07 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  22.27 
 
 		 641 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  21.45 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  37.5 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  38.98 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3567  hypothetical protein  23.44 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0186066  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  47.37 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  41.94 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2880  hypothetical protein  22.54 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  39.66 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42.37 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  42.42 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3592  PDZ/DHR/GLGF domain protein  20.25 
 
 		 412 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.713036  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.68 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  23.53 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3511  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000437292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  42.55 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.86 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1823  hypothetical protein  31.96 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  28.12 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4041  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  42.55 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  33.33 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  31.03 
 
 		 505 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  33.82 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  27.96 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0227  hypothetical protein  29.66 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.186185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  38.6 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>