68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0541 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
462 aa  928    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.86 
 
 
454 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  36.92 
 
 
392 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  39.66 
 
 
561 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  36.07 
 
 
411 aa  236  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  30 
 
 
376 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  35.12 
 
 
390 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  26.04 
 
 
392 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  35.1 
 
 
342 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  32.51 
 
 
282 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  35.15 
 
 
282 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  35.76 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  34.67 
 
 
345 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  35.88 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  30.72 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  34.55 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  31.58 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  33.8 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  33.79 
 
 
553 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  33.33 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  22.04 
 
 
244 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  34.07 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  33.6 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  31.34 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  31.72 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  27.13 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27.66 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  31.06 
 
 
269 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  32.41 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  28.44 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  31.03 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  29.08 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  25.4 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  32.89 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  35.59 
 
 
266 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  27.78 
 
 
310 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  35.33 
 
 
291 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  29.93 
 
 
312 aa  57.4  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.6 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  32.91 
 
 
250 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  23 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  22.8 
 
 
282 aa  54.3  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  31.25 
 
 
293 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  29.51 
 
 
325 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  22.73 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  32.33 
 
 
278 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1348  hypothetical protein  27.85 
 
 
552 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  24.73 
 
 
285 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  34.02 
 
 
505 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  35.53 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  26.09 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  26.9 
 
 
297 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  25.83 
 
 
275 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  34.94 
 
 
355 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  27.91 
 
 
295 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  30.97 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  30.43 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.94 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  28.45 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  26.32 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  27.21 
 
 
314 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  27.38 
 
 
476 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  27.84 
 
 
302 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.96 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24 
 
 
368 aa  43.1  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.05 
 
 
384 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>