16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1823 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1823  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  246  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4041  hypothetical protein  87.1 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1041  hypothetical protein  37.9 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.542193  normal  0.878217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244049  normal  0.740017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3017  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000100409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3376  hypothetical protein  43.14 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.28 
 
 		 390 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.96 
 
 		 393 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  28.57 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1270  hypothetical protein  31.78 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  30.49 
 
 		 313 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  27.27 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2630  putative peptidase A2A  31.13 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.550305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3027  hypothetical protein  31.96 
 
 		 345 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>