17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07896 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07896  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  926    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2272  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.65 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.494832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0001  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.18 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.74 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.55 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  25.55 
 
 		 625 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  22.71 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.51 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2079  hypothetical protein  20.71 
 
 		 641 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.139291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  20.57 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2072  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0107899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  35.62 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3915  hypothetical protein  23.04 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 554 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3204  C-terminal processing peptidase  20 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  41.54 
 
 		 454 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3567  hypothetical protein  24.9 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0186066  normal  0.0993584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>