15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0027 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0027  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  833    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  26.33 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  24.69 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  33.04 
 
 
172 aa  57.4  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  32.14 
 
 
156 aa  53.9  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  28.89 
 
 
727 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1484  hypothetical protein  28.93 
 
 
212 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  28.79 
 
 
249 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  31.61 
 
 
193 aa  44.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  31.03 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  26.36 
 
 
192 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  29.37 
 
 
225 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4032  hypothetical protein  28.66 
 
 
339 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000100028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  31.01 
 
 
232 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  34.19 
 
 
158 aa  42.7  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>