20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2617 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  99.46 
 
 
185 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  48.37 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0502  hypothetical protein  38.27 
 
 
189 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  42.14 
 
 
362 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2309  hypothetical protein  37.42 
 
 
210 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0086  hypothetical protein  36.61 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  37.29 
 
 
220 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  33.03 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  28.46 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  28.46 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
515 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  27.64 
 
 
230 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  31.63 
 
 
235 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  30.93 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  27.63 
 
 
361 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  26.85 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  23.93 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  28.7 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  28.85 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>