17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0213 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0213  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.113759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0818  hypothetical protein  45.26 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000108911  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0558  hypothetical protein  47.13 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.953712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1992  hypothetical protein  25.56 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0124  hypothetical protein  35.85 
 
 
510 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3277  hypothetical protein  36.9 
 
 
557 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  35.23 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2906  hypothetical protein  24.92 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1042  hypothetical protein  29.86 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130972  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0103  hypothetical protein  31.31 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0709647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.52 
 
 
607 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.48 
 
 
588 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0557  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  32.26 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1153  hypothetical protein  32.81 
 
 
636 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4524  hypothetical protein  26.97 
 
 
504 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0302  hypothetical protein  37.88 
 
 
510 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0358139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>