14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3277 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3277  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1117    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4720  hypothetical protein  31.67 
 
 
264 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.350704  normal  0.510959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1026  hypothetical protein  30.08 
 
 
397 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00756115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0873  hypothetical protein  25.86 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0899  hypothetical protein  25.86 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.748137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0818  hypothetical protein  37.78 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000108911  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  37.89 
 
 
607 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0213  hypothetical protein  36.9 
 
 
318 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.113759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0557  hypothetical protein  32.97 
 
 
182 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  31.11 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4157  hypothetical protein  27.08 
 
 
1074 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1239  hypothetical protein  29.76 
 
 
491 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31366  normal  0.175664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.37 
 
 
588 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2136  hypothetical protein  26.53 
 
 
998 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>