16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2253 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2253  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  745    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.101541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.47 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  24.34 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  39.44 
 
 
480 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 
462 aa  46.2  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  33.82 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  33.82 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1685  hypothetical protein  20.59 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.51 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.62 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.7 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.34 
 
 
445 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 
471 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.71 
 
 
437 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>