14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2295 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2295  putative signal peptide protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4698  hypothetical protein  63.64 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2294  hypothetical protein  44.07 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  39.82 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3020  putative signal peptide protein  35.57 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0732227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1283  conserved hypothetical signal peptide protein  31.6 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0539757  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2379  hypothetical protein  28.8 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4628  conserved hypothetical signal peptide protein  26.98 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  24.11 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1543  peptidase M16 domain-containing protein  26.94 
 
 		 682 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0867  hypothetical protein  23.27 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00009097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1183  hypothetical protein  28.81 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  25.47 
 
 		 625 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3379  hypothetical protein  23.57 
 
 		 222 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000316854  hitchhiker  0.00980308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>