12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1183 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  32.39 
 
 		 900 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1543  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1283  conserved hypothetical signal peptide protein  26.34 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0539757  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  31.31 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  22.94 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  27.46 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3020  putative signal peptide protein  27.54 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0732227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02710  Peptidase M16-like protein  24.3 
 
 		 638 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2503  hypothetical protein  25.12 
 
 		 379 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.490414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2294  hypothetical protein  23.38 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2295  putative signal peptide protein  29.06 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>