13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1283 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1283  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0539757  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  39.5 
 
 		 239 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4628  conserved hypothetical signal peptide protein  35.71 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3020  putative signal peptide protein  35.59 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0732227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2295  putative signal peptide protein  32.02 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4698  hypothetical protein  33.04 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  25.11 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2294  hypothetical protein  24.12 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1183  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3194  hypothetical protein  28.02 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  32.16 
 
 		 900 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0867  hypothetical protein  24.42 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00009097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2379  hypothetical protein  20.88 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.543799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>