12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2294 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2294  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4697  hypothetical protein  56.19 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2295  putative signal peptide protein  44.3 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4698  hypothetical protein  42.36 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3020  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0732227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4628  conserved hypothetical signal peptide protein  24 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0519  hypothetical protein  23.39 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0818804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1283  conserved hypothetical signal peptide protein  23.9 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0539757  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2379  hypothetical protein  23.55 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0867  hypothetical protein  22.13 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00009097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1183  hypothetical protein  23.46 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3469  hypothetical protein  27.06 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>