96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0265 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  100 
 
 
261 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  38.19 
 
 
234 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  35.08 
 
 
225 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  38.19 
 
 
220 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  38.92 
 
 
234 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  37.71 
 
 
231 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  34.2 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  34.83 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  33.77 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  39.67 
 
 
170 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  34.19 
 
 
233 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  36.16 
 
 
232 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  40.32 
 
 
193 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  38.84 
 
 
170 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  39.5 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  42.37 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  40.91 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4258  putative transmembrane signal peptide protein  35.95 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  35.66 
 
 
166 aa  79  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  34.25 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  40.16 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  40.91 
 
 
194 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  31.58 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  36.6 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2183  putative exported protein of unknown function  36.36 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  33.33 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2044  hypothetical protein  36.89 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0213707  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  34.71 
 
 
171 aa  75.1  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  35.66 
 
 
189 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  38.4 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  32.16 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3397  hypothetical protein  35.54 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.028147  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  40.78 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  32.26 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  39.02 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  34.88 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  41.59 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  37.8 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  35.4 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  40.62 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  33.63 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3465  hypothetical protein  33.12 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  39.01 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  35 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  38.3 
 
 
174 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  34.35 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  38.89 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  38.54 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2562  aspartyl protease-like protein  36.61 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  35.12 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  33.58 
 
 
216 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  37.68 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  30.95 
 
 
174 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  36.13 
 
 
184 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  37.31 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  31.82 
 
 
169 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  35.4 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  34.11 
 
 
169 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  37.9 
 
 
158 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  36.57 
 
 
177 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  34.51 
 
 
161 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  36.52 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  32.26 
 
 
175 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  31.34 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  30.51 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  31.97 
 
 
175 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  30.51 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  34.48 
 
 
193 aa  55.8  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  31.15 
 
 
169 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  29.77 
 
 
166 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  35.83 
 
 
172 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  35.83 
 
 
172 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  35.25 
 
 
172 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  31.97 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  30.37 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  32.8 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  36.67 
 
 
172 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  31.25 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  31.71 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  36.07 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  31.78 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0585  hypothetical protein  33.96 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.013644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  35.25 
 
 
232 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  30.65 
 
 
188 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  31.08 
 
 
160 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4782  hypothetical protein  34.34 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0468476  normal  0.490808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  30.67 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  33.33 
 
 
727 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>