95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2283 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  338  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  59.3 
 
 
180 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  43.37 
 
 
188 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  48.21 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  50.65 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  55.56 
 
 
158 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  44.77 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  46.3 
 
 
174 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  41.36 
 
 
174 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  42.68 
 
 
177 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  41.36 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  43.4 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  41.36 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  42.59 
 
 
172 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  40.74 
 
 
172 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  42.94 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  94.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  39.06 
 
 
163 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  36.3 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  35.07 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  32.52 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  32.74 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  35.96 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  32.26 
 
 
216 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  36.07 
 
 
213 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  33.05 
 
 
172 aa  61.2  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  36.75 
 
 
161 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  35.34 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  32.77 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  30.51 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  36.8 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  32.2 
 
 
218 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  36.75 
 
 
214 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1207  aspartyl protease-like  29.19 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0487674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  31.93 
 
 
191 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  38.53 
 
 
215 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  35.65 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  33.05 
 
 
213 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  31.93 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  33.56 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  33.63 
 
 
166 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  35.25 
 
 
216 aa  57.4  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  36.04 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  33.33 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  29.84 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  34.15 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  29.37 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  29.66 
 
 
220 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  30.83 
 
 
231 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  29.85 
 
 
233 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  29.85 
 
 
233 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  34.5 
 
 
169 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  35.04 
 
 
189 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  32.06 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  31.2 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2562  aspartyl protease-like protein  36.52 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  35.59 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  32.26 
 
 
234 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4782  hypothetical protein  31.9 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0468476  normal  0.490808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  32.52 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  34.26 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  32.38 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  32.26 
 
 
234 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  32.54 
 
 
230 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4231  aspartyl protease-like protein  31.71 
 
 
175 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  33.61 
 
 
244 aa  51.6  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  52  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  33.52 
 
 
230 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  29.82 
 
 
223 aa  50.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  34.71 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  31.25 
 
 
230 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  31.37 
 
 
409 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  35.59 
 
 
233 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  40.77 
 
 
235 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  33.59 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  30.41 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  31.03 
 
 
169 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  33.33 
 
 
261 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3465  hypothetical protein  32.41 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  37.84 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  29.71 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  32.48 
 
 
170 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  30.51 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  30.48 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  34.17 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  26.57 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1419  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00933773 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  26.05 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2183  putative exported protein of unknown function  32.23 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>