24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3562 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3562  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  296  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0643  hypothetical protein  45.57 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0133899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2277  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.517083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1638  hypothetical protein  48.39 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  57.63 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  48.94 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  62.75 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  51.11 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  31.34 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  37.29 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  44.23 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0353  hypothetical protein  26.97 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  40.38 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  34.69 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0262  hypothetical protein  39.62 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2283  hypothetical protein  32.67 
 
 		 185 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  26.55 
 
 		 186 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0247  hypothetical protein  47.22 
 
 		 152 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  26.55 
 
 		 186 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  35.62 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  54.29 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>