36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3706 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  306  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  35.17 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  34.53 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  32.87 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  27.7 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  31.36 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  31.47 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  27.03 
 
 
144 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  33.62 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  28.06 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2593  hypothetical protein  25.66 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  40.82 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.26 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  26.85 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  27.21 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  25.76 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  29.55 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  28.79 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  44.74 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  26.67 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  25.87 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  24.52 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  30.12 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  24.64 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  27.1 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  27.1 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  29.87 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  38.46 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2066  ATP-binding region, ATPase-like  41.03 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000294793  normal  0.545491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  40.82 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  31.18 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  24.83 
 
 
154 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  24.03 
 
 
162 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.182831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>