43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2624 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  328  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  33.71 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  27.04 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  36.71 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  28.12 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  30.13 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  30.52 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  32.5 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  54.72 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  27.78 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.99 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  30.66 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  31.61 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  28.77 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  27.54 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  27.46 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  28.99 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2593  hypothetical protein  25.87 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  31.82 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  35.03 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  42.5 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  47.37 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  32.63 
 
 
147 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  27.54 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  20 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  30.3 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  26.52 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  47.37 
 
 
217 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  24.31 
 
 
201 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  25.78 
 
 
154 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  24.71 
 
 
162 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  39.53 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  38.89 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  28.12 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  27.43 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>