19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1858 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  46.07 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  39.76 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  39.63 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  36.26 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  32.47 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  31.55 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  33.52 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  31.68 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  26.16 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  32.73 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  31.85 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  33.75 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  34.41 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  30.91 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  30.46 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  34.44 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  27.95 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  27.57 
 
 		 162 aa  42  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>