18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3007 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  358  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  51.12 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  52.78 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  44.81 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  52.78 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  45.71 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  46.11 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  44.75 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  35.59 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  36 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  32.54 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  33.75 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  27.84 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  31.64 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  34.08 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  30.68 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  56.82 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>