16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1304 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  100 
 
 		 179 aa  357  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  94.41 
 
 		 179 aa  316  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  75.42 
 
 		 173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  36.84 
 
 		 201 aa  87.8  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  32.61 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  35.52 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  28.48 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  29.45 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  33.14 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  31.35 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  29.14 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  27.75 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  27.68 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  26.11 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>