20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3371 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  51.89 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  61.54 
 
 		 200 aa  164  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  59.52 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  50.28 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  45.35 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  50.88 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  54.34 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  52.5 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  41.07 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  40.12 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  35.03 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  29.82 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  34.05 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  32.6 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  32.8 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  31.97 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  34 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  26.67 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>