19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1259 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  98.18 
 
 		 200 aa  319  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  61.31 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  53.25 
 
 		 206 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  44.51 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  56.97 
 
 		 191 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  49.71 
 
 		 180 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  54.72 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  47.65 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  37.41 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  39.63 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  32.78 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  29.56 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  33.14 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  32.58 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  31.29 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  30.59 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  25.32 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  31.08 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>