24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1619 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  100 
 
 		 165 aa  323  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  44.31 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  42.41 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  39.76 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  39.18 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  40.83 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  42.59 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  40.94 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  39.62 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  25.9 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  36.48 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  31.52 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  43.87 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  33.73 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  33.52 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  35.17 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  29.52 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  30.61 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  28.65 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  29.14 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  28.99 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  28.48 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  28.24 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>