18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1459 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  44.44 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  33.53 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  37.79 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  27.12 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  35.39 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  29.89 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  35.52 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  43.86 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  31.46 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  43.14 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  42.11 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  37.25 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  31.07 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  28.4 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>