19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2002 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  64.8 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  50.88 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  54.55 
 
 		 170 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  49.73 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  50.89 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  49.7 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  51.55 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  48.55 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  39.2 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  34.32 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  31.17 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  32.52 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  30.81 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  28.48 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  29.68 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  29.73 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  28.75 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>