19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3900 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  51.45 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  56.97 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  58.18 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  47.16 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  51.41 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  49.43 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  47.93 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  46.58 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  38.79 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  43.31 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  33.54 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  30.39 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  32.96 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  32.4 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  32.65 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  29.48 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.9 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  31.72 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>